In countries where there are no authorised GM waste treatment facilities, the users inactivate their GMO waste themselves (Denmark, Estonia) or use the general waste treatment facilities available (Belgium, Bulgaria, Hungary, the Czech Republic, Spain and Sweden).
Riikides, kus puuduvad spetsiaalsed geneetiliselt muundatud jäätmete käitlusrajatised, inaktiveerivad kasutajad oma GMO jäätmed ise (Eesti, Taani) või kasutavad üldisi jäätmekäitlusrajatisi (Belgia, Bulgaaria, Hispaania, Rootsi, Tšehhi Vabariik ja Ungari).