# [B11] 自然史標本データベース「サイエンス・ミュージアムネ ットの現状と課題

○細矢剛 1), 神保宇嗣 2), 中江雅典 2), 海老原淳 ${ }^{3}$, , 水沼登志恵 ${ }^{1)}$

1) 国立科学博物館 標本資料センター, 〒 305-0005 茨城県つくば市天久保 4-1-1

2) 国立科学博物館 動物研究部, 国立科学博物館 植物研究部

E-mail: hosoya@kahaku.go.jp
## The current status and challenges of the natural historical collection database "Science Museum Net"

HOSOYA Tsuyoshi ${ }^{1}$, , JINBO Utsugi ${ }^{2}$, NAKAE Masanori ${ }^{2}$, EBIHARA Atsushi ${ }^{2}$, MIZUNUMA Toshie ${ }^{1)}$

1) Collection Center, National Museum of Nature and Science, 1-1-1 Amakubo, Tsukuba, Ibaraki, 305-0005 Japan

2) Department of Zoology, National Museum of Nature and Science, ${ }^{3)}$ Department of Botany, National Museum of Nature and Science

## 【発表概要】

気候変動解析や保全政策などのためには、どこにどのような生物がいたかというオカレンスデ一夕（在データ）は重要であり、多数のデータを集積して利用するという活動が必要となる。 GBIF（地球規模生物多様性情報機構）はこの目的で 2001 年に設立された。この活動のため、日本の機関から生物系の自然史データを収集し、国内利用のためにデータを公開しているのがサイエンス・ミュージアムネットである。S-Net は、国立科学博物館が運営する標本情報の公開サイトであり、現在 80 を超える日本全国の協力機関から収集された 450 万件の自然史標本データが公開されており、検索・ダウンロードの他、検索結果を地図に表示することができる。これらのデータは、チェックリストの作成や、分布域の予想などに利用されている。S-Net から公開されているデータの大部分は動物および植物であり、菌類のデータ数は限られている。また、デー 夕は日本全域をカバーしてはいるが、数は全国で一定ではない、などの課題も多い。

## 1. はじめに

気候変動解析や保全政策などのためには、 どこにどのような生物がいたかというオカレンスデータ（在データ）は重要である。オカレンスデータは、観察・文献な[3]。しかし、標本のもつデータは多くの場合、デジタル化されていない。また、環境評価などの目的のためには、限られた数のデータではなく、多数のデータを集積して利用することが必要で、多数のオカレンスデータを世界中から収集し、利用するという活動が必要となる。本講演では、この目的のために活動を展開する GBIF （地球規模生物多様性情報機構）および、 GBIF に提供されているデータの国内利用を目的に設けられたサイエンス・ミュージアムネットについて述べ、後者の現状と課題について議論する。

## 2. 自然史情報の共有

## 2. 1 GBIF と S-Net

GBIF はインターネットを通じて生物多様性情報（いつ、どこに、どんな生物がいたのか、それが何を根拠とするか）をどこでもだれでも利用できることを実現するため、2001 年に設立されたもので、我が国もメンバーとして参加している [2]。 GBIF のウェブサイトからは、世界各国から収集された 9.6 億件ものデータが公開されており、自由にダウンロード可能となっている。 これらのデータは、現在年間 700 件を越える論文に引用され、分類・生態学的研究、とりわけ保全生物学的な研究には久くことができないものになっている。この活動のため、日本では複数の博物館から標本データを収集し、提供しているが、国際的な活動なため、日本
語情報が落ちてしまう。そこで、日本語情報を使えるようにしてデータを公開しているのが国立科学博物館が運営する標本情報と自然史系研究員・学芸員の情報の公開サイトであるサイエンス・ミュージアムネット（S-Net、 http://science-net.kahaku.go.jp/) である。当初、S-Net には、自然史系博物館における展示情報を横串検索し、提示する機能も備えられていた。しかし、Google などの検索機能向上により、この機能は現在では停止され、現在のような形になった（図 1）。

図 1. S-Net のホームページ（2018.12.30.)

## 2. $2 \mathrm{~S-\mathrm{Net}$ の現状と課題}

S-Net では、現在、北海道から沖縄までの広範囲にある 80 を超える日本全国の協力機関から収集された 450 万件の自然史標本デー タが公開されている。その大部分は、自然史系博物館（含、大学博物館）の標本に由来するが、公立の研究所や大学なども含まれる。提供されたデータは、検索・ダウンロードしたりできる他、検索結果を地図にプロットして表示することができる。これらの集積されたデータは、チェックリストの作成、分布地図の作成などの自然史や分類・生態学の基盤情報として用いられる他、分布域の予想などの応用面でも利用されている。より具体的な利用例としては、

「県内産の維管束植物の分布状況の整理のため」、「特定の動植物の分布状況を調べる際になど」、「都道府県レベルで生物の分布を調べる時など」、「インベントリー調查の基礎資料として」、「生物分布から地域の特徴を見出すのに利用」、「特定の生物種の標本の収蔵状況の把握」などである。残念ながら、現時点で S-Net に収められている標本情報の多くは最近のものが多く、GBIF のデー タによってなされているような過去の長期にわたる出現傾向の分析に適用するには限界があると思われる。

S-Net でのデータ公開により、データ提供機関は、自前のサーバーを準備することなく、自館のデータを公開でき、これを教育・普及のための材料として利用できる。また、他機関のデータと連携することによって、データを地域の生物目録（チェックリスト）の作成などにも利用でき、保全行政などの意思決定の材料を提供できる。

S-Net には、絶滅危惧種のデータも含まれている。しかし、これらについては、詳細地名は公開していない（原則として市町村までのみ公開。どこまで隠すかはデータ提供館の判断に従っており、種ごとに細かい指示がある場合もある。絶滅危惧種によらず、一律市町村までの非公開、という機関もある）。この結果、保全生物学上重要な生物については、産地情報の管理には機関による差異が生じている。しかしながら、GBIF のデータと同様、 S-Net も Darwin Core と呼ばれる生物多様性情報データの標準的な記述にほぼ準拠している。そのため、他の自然史系データセットとの互換性はよい。ここで、DarwinCore (DwC) とは、TDWG (Taxonomic Data Working Group。現在では Biodiversity Information Standards と改名したが、相変わらず、TDWG で通じることが多い）が提唱した生物多様性情報を記述するための用語 (データベースフィールド) である。 $\mathrm{DwC}$ には現在 180 を越える用語が提唱されており、 さらに拡張することによって、生態学的なデ一タへの適用が図られている。DwC に従って標本情報を記述することによって、自然史系の標本情報は共通のプラットフォームで記述されることになり、世界的な規模で互換性が保証される[1]。

また、GBIF に提供されるデータは、デー タセットごとに Creative Commons (CC) ライセンスが設定されているため（CC0 あるいは CC BY が推奖されている）、S-Netデータもこれに準ずるものとして提出時に意向を調査している。現在のところ CC BY がもっとも多く（82\%）、ついで CC BY-NC（17\%）、 $\mathrm{CC0}$ (1\%) となっている。

2016 年 4 月から 2017 年 3 月での調查では、 S-Net は毎月平均 30.3 回のアクセス（最小 3 ,最大 781 回／日）と 22.1 回のデータダウンロード（最小 1 ，最大 289 回/日）をカウントしており、博物館関係の研究者ばかりでなく、行政関係からも利用されている（図 2）。

図 2.S-Net の検索・ダウロード頻度 (2016.4.-2017.3.)

S-Net から公開されているデータの大部分は動物および植物であり、菌類のデータ数は限られている（図 3）。また、現時点では、化石など、古生物分野のデータを入力することはできない。さらに、学名の誤りに対する修正機能は限られており、分類学的知見の増加にともなって、最新の学名が使用されていないなど、データの品質に関しても問題がないわけではない。また、データは日本全域をカバーしてはいるが、数は全国で一定ではない（データが多い県と少ない県がある）、などの課題も多い。

GBIF は 5 年を 1 期として中期計画を持っており、2017-2021 は 1）科学および社会で必要とされているデータを提供する；2）デー タの質を向上する；3）データのギャップを埋める；4）インフラ整備を推進する；5）国際的ネットワークへ注力する、の 5 点が掲げられている。これに対応して、GBIF の日本ノ一ド（支部に相当する）[4]も中期計画をもつており、S-Net 関連では、上記の 1）に関連して、(1)データの利用者・提供者の両方に教育普及を推進すること、(2)データの使用例を収集し、データ活用を推進することなどが、 3）のデータ品質に関しては、(1)エラー低減の方策を検討する、(2)精度向上のための情報基盤（辞書・ツールなど）を整備する、(3)現場担当者の能力開発と支援を推進することが、

4）に関連しては、S-Net のガバナンスと実施体制を強化することなどが求められ、課題となっている

## 3. 今後の展望

S-Net からのデータ公開は 10 年を超え、相当数のデータを保有し、知名度も上がってきた。日本国内での利用を考えると、日本語環境での利用ニーズへの対応は極めて重要である。また、2018 年 4 月より、S-Net は受注業者が変更となったため、これを機会に、さらにシステムの使い勝手の向上や新しい運営体制に適応することが必要である。新規なシステムでは、従来扱うことができなかった化石にも対応する予定である（本予稿準備中に、 フィールドの設計が行われている)。

S-Net で取り扱われているデータセットは

200 を超え、広範囲（多種類）かつ多数のデ一タを取扱うため、運営体制も安定したものである必要がある。現在のところ、これはナショナルバイオリソースプロジェクト

（NBRP）からの補助金によって可能となっており、今後も安定した資金提供が望まれる。

## 4. おわりに

自然史は、自然科学の基盤となる分野で、 さまざまな事象を記載し、共有することを使命としている。その際、客観性と再現性を担保するためには物的標本の存在は極めて重要である。自然史系博物館は、この目的のための物的証拠を集積・保存するためのアーカイブ機関と考えられ、文化財などのアーカイブと決して無縁ではない。自然史系資料の多くは、単独ではなく、多数が集まることによって、価値を発揮する。より存在感をもって自然史系アーカイブが機能するためには、よりいっそうの連携が求められる。その基本となるのは、自分のデータ提供が、人を利すると
ともに、自分も利することになるという「オ ープンマインドな精神」である[5]。個々のデ一タをまとめ、再利用することによって、力を生むという情報の拡大再生産がよりいっそう求められる。

## 参考文献

[1]. 大澤剛士、戸津久美子． 2017，保全生態学研究 22 , p. 371-381.

[2] 細矢剛. 地球規模生物多様性情報機構 GB IF の働きと役割. 2016, 日本生態学会誌 66 , p. 209-214.

[3] 細矢剛. 生物多様性情報学の時代（1）標本の情報を集める意味. 2015 ，グリーンパワ

一. 5 , p. 28.

[4] 細矢剛. 生物多様性情報学の時代（3）情報提供を担う JBIF. 2015，グリーンパワー.

7, p. 28.

[5] 細矢剛. 生物多様性情報学の時代 (3) オ ープンマインドでいこう. 2015，グリーンパワー. 12, p. 28.

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