Kwa kuwa Nagasaki ilikuwa kituo cha biashara ya Magharibi, jiji hilo lilisaidia Kanisa Katoliki la Japani, ambalo leo limefufuliwa baada ya miaka 250 ya ukandamizaji mkali chini ya utawala wa shogun wa Tokugawa.
Nagasaki ilitumika kama kituo cha biashara ya Magharibi na ngome ya Kanisa Katoliki.