Ingawa nitrojeni ni muhimu virutubisho, upatikanaji wake ni asili mdogo, na hivyo ni sababu muhimu katika kudhibiti muundo na utendaji wa wote ardhi na maji mifumo ya ikolojia.
Muundo na utendaji wa mifumo ya ikolojia ya nchi kavu na ya majini husimamiwa na nitrojeni.