Hideyoshi aliona Ukristo kuwa tisho kwa mamlaka yake kuu, na kwa utaratibu akazuia utendaji wa Kikristo; mwaka wa 1597 wamishonari sita na Wajapani 20 waliobadilishwa imani waliuawa msalabani huko Nagasaki.
Hideyoshi aliona Ukristo kuwa tatizo la kudumisha mamlaka yake, na hivyo akawakandamiza kwa kutekeleza hukumu za kifo.