FEMA pia inakabiliwa na changamoto maalum zinazohusiana na utume, ikiwa ni pamoja na kutoa majibu ya wakati kwa maombi ya msaada wa maafa, kuzuia au kupunguza uharibifu na hasara kutoka kwa maafa ya baadaye kupitia juhudi za kupunguza gharama, na kufanya kazi kwa ufanisi na programu zingine za shirikisho, serikali, na za mitaa.
FEMA ina changamoto zinazohusiana na utume ambazo ni za kipekee.